Białka rekombinowane i ukierunkowana mutageneza (WBt-BCH350)
Liczba godzin:
15 godzin wykładów, 45 godzi ćwiczeń (7 ćwiczeń po 6,5 godziny)
Punkty ECTS: 4
Semestr:
letni
Dla kogo:
kurs dla studentów studiów II stopnia kierunka Biochemia
Koordynator kursu: prof. Marta Dziedzicka-Wasylewska
Wykładowcy: dr Ewa Błasiak, dr Ewelina Fic
Prowadzący ćwiczenia: dr Ewelina Fic
Godzina i miejsce wykładów:
Czwartek, 12:00–14:00, sala 1.01.17
Godzina i miejsce ćwiczeń:
wtorek, godz. 9:00-13:45 (grupa 1)
środa, godz. 12:30-17:15 (grupa 2)
Pracownie znajdujące się na terenie ZBF
Opis kursu:
Wykłady: Praktyczne aspekty projektowania oraz wytwarzania białek o zmodyfikowanej strukturze i/lub funkcji w prokariotycznych oraz eukariotycznych systemach ekspresyjnych. Czynniki wpływające na wydajność transkrypcji i translacji genów, procesy fałdowania i agregacji białek w komórce, systemy wydzielania białek. Metody wprowadzania mutacji i tworzenia białek fuzyjnych. Przykłady wykorzystania białek fuzyjnych i etykietek m.in. do oczyszczania oraz detekcji białek rekombinowanych. Synteza oligonukleotydów i sekwencjonowanie DNA.
Ćwiczenia: Zastosowanie łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) do modyfikacji białek na drodze mutagenezy ukierunkowanej. Wklonowanie zmutowanego genu do wektora
ekspresyjnego. Transformacja bakterii. Hodowla bakterii E.coli w celu otrzymania białka rekombinowanego. Oczyszczanie białka przy użyciu wybranych technik chromatograficznych. Oznaczanie czystości uzyskanych białek za pomocą SDS-PAGE.
Regulamin kursu
- W trakcie trwania kursu dopuszcza się 1 usprawiedliwioną nieobecność na ćwiczeniach. Spóźnienie większe niż 15 minut daje prowadzącemu prawo niewpuszczenia studenta na zajęcia.
- Warunkiem zaliczenia poszczególnych ćwiczeń jest oddanie sprawozdania. Sprawozdania mogą być pisane w parach lub indywidualnie.
- Czas na oddanie sprawozdania wynosi 1 tydzień, za każdy tydzień zwłoki ocena wyjściowa jest obniżana o pół stopnia.
- Za sprawozdanie zawierające plagiat student otrzymuje ocenę niedostateczną.
- W trakcie kursu każdy student zobowiązany jest do wygłoszenia referatu związanego z tematyką ćwiczeń. Referat jest oceniany.
- Ocena końcowa z ćwiczeń jest średnią arytmetyczną z ocen za sprawozdania i referat.
- Warunkiem dopuszczenia do końcowego kolokwium zaliczeniowego (pytania testowe jednokrotnego wyboru) jest uzyskanie zaliczenia z ćwiczeń (ocena co najmniej dostateczna).
- Warunkiem zaliczenia kursu jest uzyskanie zaliczenia z ćwiczeń oraz pozytywna ocena z końcowego kolokwium zaliczeniowego.
- Ocena końcowa z kursu jest średnią ważoną ocen z ćwiczeń (25%) i testu zaliczeniowego (75%) pod warunkiem, że obie oceny są ocenami pozytywnymi.
Harmonogram wykładów
Harmonogram ćwiczeń
Literatura
- J. M. Berg, L. Stryer, J. L. Tymoczko „Biochemia" Wydawnictwo Naukowe PWN 2007
- P.C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White „Biologia molekularna. Krótkie wykłady" Wydawnictwo Naukowe PWN 2007
- A. Kozik, M. Rąpała-Kozik, I. Guevara-Lora „Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane problemy i metody instrumentalnej biochemii analitycznej. Seria Wydawnicza IBM UJ, 2001
- B. Walkowiak „Techniki chromatografii cieczowej. Przykłady zastosowań". Amersham Pharmacia Biotech. MORPOL, Lublin 2000
- „Protein Electrophoresis. Technical Manual" Amersham Biosciences, 1999.